Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WXM4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A087WXM4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A087WXM4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms