Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYVE1Q9Y5Y7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms