Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms