Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC2Q9Y235 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC2Q9Y235 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms