Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TNIKQ9UKE5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TNIKQ9UKE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TNIKQ9UKE5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms