Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF11Q9UIL8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF11Q9UIL8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms