Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms