Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms