Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP2Q9P2J9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP2Q9P2J9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms