Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
GMIPQ9P107 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GMIPQ9P107 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GMIPQ9P107 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GMIPQ9P107 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms