Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX43Q9NXZ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms