Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf42Q9NWW7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf42Q9NWW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf42Q9NWW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms