Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3EQ9NVU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3EQ9NVU0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms