Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCM2LQ9NUG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms