Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THSD1Q9NS62 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THSD1Q9NS62 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms