Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPORSQ9NS56 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOPORSQ9NS56 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms