Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRA1Q9HD15 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms