Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAB2Q9HCS7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms