Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POPDC2Q9HBU9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms