Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UPF2Q9HAU5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF2Q9HAU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms