Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2DQ9H6A0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND2DQ9H6A0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms