Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6CQ9H3T2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6CQ9H3T2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms