Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZCCHC2Q9C0B9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC2Q9C0B9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms