Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
INO80BQ9C086 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80BQ9C086 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80BQ9C086 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80BQ9C086 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80BQ9C086 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80BQ9C086 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80BQ9C086 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80BQ9C086 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80BQ9C086 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80BQ9C086 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms