Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHCBP1LQ9BZQ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHCBP1LQ9BZQ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHCBP1LQ9BZQ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms