Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITPNM3Q9BZ71 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITPNM3Q9BZ71 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms