Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNG6Q9BXT2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNG6Q9BXT2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms