Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VN1R3Q9BXE9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VN1R3Q9BXE9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VN1R3Q9BXE9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms