Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMED9Q9BVK6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms