Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF4Q9BUZ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.8 ms