Protein–RNA interactions for Protein: Q99878

HIST1H2AJ, Histone H2A type 1-J, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2AJQ99878 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIST1H2AJQ99878 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST1H2AJQ99878 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H2AJQ99878 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms