Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPA33Q99795 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms