Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms