Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN18Q96SJ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN18Q96SJ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms