Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1CQ96SD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1CQ96SD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1CQ96SD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1CQ96SD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCLRE1CQ96SD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms