Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCNAQ96QF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms