Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CR12Q96Q35 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms