Protein–RNA interactions for Protein: Q96PG1

MS4A4E, Putative membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4E, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4EQ96PG1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A4EQ96PG1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A4EQ96PG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4EQ96PG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms