Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1AQ96P16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRD1AQ96P16 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms