Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF558Q96NG5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms