Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q96MF0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q96MF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q96MF0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q96MF0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q96MF0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q96MF0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q96MF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q96MF0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q96MF0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q96MF0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q96MF0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q96MF0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q96MF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q96MF0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q96MF0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q96MF0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q96MF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q96MF0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q96MF0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q96MF0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q96MF0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q96MF0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q96MF0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q96MF0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q96MF0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q96MF0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q96MF0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q96MF0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q96MF0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q96MF0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q96MF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q96MF0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q96MF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q96MF0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q96MF0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q96MF0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q96MF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q96MF0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q96MF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q96MF0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q96MF0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q96MF0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q96MF0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q96MF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q96MF0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms