Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2E2Q96LR5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2E2Q96LR5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE2E2Q96LR5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE2E2Q96LR5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE2E2Q96LR5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE2E2Q96LR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE2E2Q96LR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBE2E2Q96LR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2E2Q96LR5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms