Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP6Q96FZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP6Q96FZ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms