Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC39Q96DD0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC39Q96DD0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC39Q96DD0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms