Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHDC3Q96DC8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC3Q96DC8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC3Q96DC8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC3Q96DC8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC3Q96DC8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC3Q96DC8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC3Q96DC8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC3Q96DC8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC3Q96DC8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC3Q96DC8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms