Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGMAQ96B86 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMAQ96B86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms