Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.244e-10■■■■■ 86.3
TBRG4Q969Z0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 86
TBRG4Q969Z0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 86
TBRG4Q969Z0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 86
TBRG4Q969Z0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.082e-6■■■■■ 84.9
TBRG4Q969Z0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 84.9
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TBRG4Q969Z0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 84.9
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TBRG4Q969Z0 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-9■■■■■ 84.6
TBRG4Q969Z0 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.011e-9■■■■■ 84.6
TBRG4Q969Z0 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 84.6
TBRG4Q969Z0 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.031e-9■■■■■ 84.6
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TBRG4Q969Z0 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 83.7
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TBRG4Q969Z0 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 53.6□□□□□ -1.837e-8■■■■■ 83.7
TBRG4Q969Z0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 83.4
TBRG4Q969Z0 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.59■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 83.4
TBRG4Q969Z0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 83.4
TBRG4Q969Z0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 83.4
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TBRG4Q969Z0 AL669831.3-203ENST00000419394 491 ntTSL 52.91□□□□□ -1.944e-7■■■■■ 82.9
TBRG4Q969Z0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 82.9
TBRG4Q969Z0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 82.7
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TBRG4Q969Z0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.462e-10■■■■■ 82.5
TBRG4Q969Z0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-10■■■■■ 82.5
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TBRG4Q969Z0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 82.5
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TBRG4Q969Z0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 82.5
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TBRG4Q969Z0 TBC1D1-217ENST00000511238 572 ntTSL 35.12□□□□□ -1.592e-10■■■■■ 82.5
TBRG4Q969Z0 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.962e-10■■■■■ 82.5
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TBRG4Q969Z0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.011e-8■■■■■ 82.4
TBRG4Q969Z0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 82.4
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TBRG4Q969Z0 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 82.4
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TBRG4Q969Z0 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 82.4
TBRG4Q969Z0 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 82.4
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TBRG4Q969Z0 ASTN2-203ENST00000341734 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 82.4
TBRG4Q969Z0 ASTN2-207ENST00000373986 3812 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.17□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 82.4
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TBRG4Q969Z0 RAB4A-204ENST00000489342 431 ntTSL 54.44□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 82.4
TBRG4Q969Z0 SIPA1L1-206ENST00000554362 552 ntTSL 53.13□□□□□ -1.919e-7■■■■■ 82.4
TBRG4Q969Z0 PPIG-210ENST00000482772 982 ntTSL 52.5□□□□□ -2.013e-12■■■■■ 82.4
TBRG4Q969Z0 PPIG-209ENST00000466142 735 ntTSL 22.11□□□□□ -2.073e-12■■■■■ 82.4
TBRG4Q969Z0 SIPA1L1-205ENST00000554126 576 ntTSL 50.62□□□□□ -2.319e-7■■■■■ 82.4
TBRG4Q969Z0 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.14□□□□□ -0.151e-16■■■■■ 82.3
TBRG4Q969Z0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 82.2
TBRG4Q969Z0 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 517.36■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 81.4
TBRG4Q969Z0 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 81.4
TBRG4Q969Z0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.636e-9■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 RBPMS-220ENST00000523717 886 ntTSL 314.5□□□□□ -0.096e-9■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.949e-9■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 RTTN-209ENST00000583043 6278 ntTSL 1 (best)6.13□□□□□ -1.439e-9■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 RTTN-214ENST00000639128 4547 ntTSL 55.69□□□□□ -1.59e-9■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.576e-9■■■■■ 81.1
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TBRG4Q969Z0 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.89e-9■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 RBPMS-219ENST00000523115 449 ntTSL 33.02□□□□□ -1.936e-9■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 RBPMS-214ENST00000521816 98 ntTSL 31.13□□□□□ -2.236e-9■■■■■ 81.1
TBRG4Q969Z0 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 80.7
TBRG4Q969Z0 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 80.5
TBRG4Q969Z0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.45e-9■■■■■ 80.4
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