RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531558.1

PICALM-215, Transcript of phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein, humanhuman

TSL 5

Gene PICALM, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALM-215ENST00000531558 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.7■■■■■ 7.63
PICALM-215ENST00000531558 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.7■■■■■ 6.51
PICALM-215ENST00000531558 ABCC9O60706 1549 aa54.46■■■■■ 6.31
PICALM-215ENST00000531558 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.41■■■■■ 5.98
PICALM-215ENST00000531558 NACADO15069 1562 aa52.37■■■■■ 5.97
PICALM-215ENST00000531558 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.29■■■■■ 5.96
PICALM-215ENST00000531558 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.25■■■■■ 5.96
PICALM-215ENST00000531558 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.1■■■■■ 5.93
PICALM-215ENST00000531558 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.89■■■■■ 5.9
PICALM-215ENST00000531558 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.16■■■■■ 5.78
PICALM-215ENST00000531558 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.89■■■■■ 5.74
PICALM-215ENST00000531558 SCRIBQ14160 1630 aa50.84■■■■■ 5.73
PICALM-215ENST00000531558 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.83■■■■■ 5.73
PICALM-215ENST00000531558 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.34■■■■■ 5.65
PICALM-215ENST00000531558 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.93■■■■■ 5.58
PICALM-215ENST00000531558 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.49■■■■■ 5.51
PICALM-215ENST00000531558 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.27■■■■■ 5.48
PICALM-215ENST00000531558 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.94■■■■■ 5.43
PICALM-215ENST00000531558 SMARCA4P51532 1647 aa48.63■■■■■ 5.38
PICALM-215ENST00000531558 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.59■■■■■ 5.37
PICALM-215ENST00000531558 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.37■■■■■ 5.33
PICALM-215ENST00000531558 NCAPD3P42695 1498 aa48.34■■■■■ 5.33
PICALM-215ENST00000531558 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.32■■■■■ 5.33
PICALM-215ENST00000531558 SMARCA2P51531 1590 aa48.31■■■■■ 5.32
PICALM-215ENST00000531558 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.17■■■■■ 5.3
PICALM-215ENST00000531558 HMGXB3Q12766 1538 aa48.11■■■■■ 5.29
PICALM-215ENST00000531558 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
PICALM-215ENST00000531558 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.79■■■■■ 5.24
PICALM-215ENST00000531558 WIZO95785 1651 aa47.76■■■■■ 5.24
PICALM-215ENST00000531558 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
PICALM-215ENST00000531558 NESP48681 1621 aa47.15■■■■■ 5.14
PICALM-215ENST00000531558 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.03■■■■■ 5.12
PICALM-215ENST00000531558 ERCC6Q03468 1493 aa46.95■■■■■ 5.11
PICALM-215ENST00000531558 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.93■■■■■ 5.1
PICALM-215ENST00000531558 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.73■■■■■ 5.07
PICALM-215ENST00000531558 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.73■■■■■ 5.07
PICALM-215ENST00000531558 CFTRP13569 1480 aa46.67■■■■■ 5.06
PICALM-215ENST00000531558 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
PICALM-215ENST00000531558 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.55■■■■■ 5.04
PICALM-215ENST00000531558 CUX2O14529 1486 aa46.44■■■■■ 5.03
PICALM-215ENST00000531558 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
PICALM-215ENST00000531558 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.38■■■■■ 5.02
PICALM-215ENST00000531558 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.33■■■■■ 5.01
PICALM-215ENST00000531558 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.26■■■■■ 5
PICALM-215ENST00000531558 PRDM2Q13029 1718 aa46.25■■■■■ 4.99
PICALM-215ENST00000531558 WDR62O43379 1518 aa46.11■■■■■ 4.97
PICALM-215ENST00000531558 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
PICALM-215ENST00000531558 TOPBP1Q92547 1522 aa45.65■■■■■ 4.9
PICALM-215ENST00000531558 ABCC8Q09428 1581 aa45.63■■■■■ 4.9
PICALM-215ENST00000531558 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.61■■■■■ 4.89
PICALM-215ENST00000531558 IFT140Q96RY7 1462 aa45.36■■■■■ 4.85
PICALM-215ENST00000531558 CUX1P39880 1505 aa45.33■■■■■ 4.85
PICALM-215ENST00000531558 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
PICALM-215ENST00000531558 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.17■■■■■ 4.82
PICALM-215ENST00000531558 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
PICALM-215ENST00000531558 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
PICALM-215ENST00000531558 SOGA1O94964 1423 aa45.07■■■■■ 4.81
PICALM-215ENST00000531558 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.06■■■■■ 4.8
PICALM-215ENST00000531558 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.06■■■■■ 4.89e-8■□□□□ 8.4
PICALM-215ENST00000531558 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
PICALM-215ENST00000531558 TOP2BQ02880 1626 aa44.94■■■■■ 4.79
PICALM-215ENST00000531558 SYNJ1O43426 1573 aa44.94■■■■■ 4.78
PICALM-215ENST00000531558 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.93■■■■■ 4.78
PICALM-215ENST00000531558 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.93■■■■■ 4.78
PICALM-215ENST00000531558 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.89■■■■■ 4.789e-9■■■■□ 19.5
PICALM-215ENST00000531558 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.76
PICALM-215ENST00000531558 WDR97A6NE52 1622 aa44.8■■■■■ 4.76
PICALM-215ENST00000531558 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.74■■■■■ 4.75
PICALM-215ENST00000531558 GRIN2BQ13224 1484 aa44.56■■■■■ 4.72
PICALM-215ENST00000531558 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.56■■■■■ 4.72
PICALM-215ENST00000531558 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.56■■■■■ 4.72
PICALM-215ENST00000531558 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.5■■■■■ 4.71
PICALM-215ENST00000531558 OSCARQ8IYS5 282 aa44.49■■■■■ 4.71
PICALM-215ENST00000531558 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
PICALM-215ENST00000531558 PBRM1Q86U86 1689 aa44.42■■■■■ 4.7
PICALM-215ENST00000531558 CHD1O14646 1710 aa44.35■■■■■ 4.69
PICALM-215ENST00000531558 FBLN2P98095 1184 aa44.31■■■■■ 4.68
PICALM-215ENST00000531558 SYNJ2O15056 1496 aa44.27■■■■■ 4.68
PICALM-215ENST00000531558 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
PICALM-215ENST00000531558 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.2■■■■■ 4.67
PICALM-215ENST00000531558 ADAMTS12P58397 1594 aa44.14■■■■■ 4.66
PICALM-215ENST00000531558 KIF27Q86VH2 1401 aa44.11■■■■■ 4.65
PICALM-215ENST00000531558 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.06■■■■■ 4.64
PICALM-215ENST00000531558 TRIM41Q8WV44 630 aa43.99■■■■■ 4.63
PICALM-215ENST00000531558 GRIN2AQ12879 1464 aa43.99■■■■■ 4.63
PICALM-215ENST00000531558 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.93■■■■■ 4.62
PICALM-215ENST00000531558 IGF1RP08069 1367 aa43.92■■■■■ 4.62
PICALM-215ENST00000531558 ARHGEF11O15085 1522 aa43.81■■■■■ 4.6
PICALM-215ENST00000531558 NUP160Q12769 1436 aa43.81■■■■■ 4.6
PICALM-215ENST00000531558 CUL7Q14999 1698 aa43.79■■■■■ 4.6
PICALM-215ENST00000531558 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.78■■■■■ 4.6
PICALM-215ENST00000531558 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.78■■■■■ 4.6
PICALM-215ENST00000531558 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.78■■■■■ 4.6
PICALM-215ENST00000531558 CEP170Q5SW79 1584 aa43.75■■■■■ 4.59
PICALM-215ENST00000531558 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.7■■■■■ 4.59
PICALM-215ENST00000531558 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.66■■■■■ 4.58
PICALM-215ENST00000531558 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.49■■■■■ 4.55
PICALM-215ENST00000531558 ARAP1Q96P48 1450 aa43.47■■■■■ 4.55
PICALM-215ENST00000531558 SHROOM2Q13796 1616 aa43.44■■■■■ 4.54
PICALM-215ENST00000531558 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.41■■■■■ 4.54
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