Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
P3H4Q92791 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
P3H4Q92791 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
P3H4Q92791 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms