Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SFT2D1Q8WV19 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms